Archivo para la categoría Filosofadas

Bailando con Proteínas y el Nobel

ironhorse

Pues sí, el Nobel de Química de este año ha sido concedido a Karplus, Lewitt y Warshell por su trabajo de desarrollo de modelos mutiescala para tratar sistemas químicos complejos.  Si uno lee con más atención la nota de prensa publicada en el sitio web del Premio Nobel, parece que el jurado ha valorado en concreto la utilización de métodos mixtos QM/MM para estudiar problemas de reactividad química en proteínas y sistemas biológicos en general. Para que nos entendamos, Biología, Química, Física, Matemática y Computación unidas para tratar sistemas biológicos. En resumen, estos “cocineros” de la Química Computacional fueron pioneros en preparar un plato compuesto por un muchito de Newton (métodos clásicos y propagación de las posiciones) con un poquito de Schrödinger (rotura y formación de enlaces químicos), adobado en una salsa de Maxwell (continuo dieléctrico) .  Pero hoy me gustaría dedicar este Post, a hablar de mis recuerdos en el grupo de Karplus, porque el que aquí escribe tuvo la oportunidad de ensayar esos platos y de ser su pinche de cocina durante cuatro maravillosos años.

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Université de Paris Marie Curie

ironhorse

Pues como os decía en el FB, esta semana he hecho una visita al laboratorio de Chimie de Surfaces de la Université de Paris Marie Curie. Estamos colaborando con la profesora Dominique Costa en la simulación de superóxidos en agua en presencia de aluminio, utilizando técnicas de dinámica molecular ab-initio (usando la teoría del funcional de la densidad). Como ya os he contado en algún Post anterior, la interacción Al-superóxido es fundamental para entender el posible efecto pro-oxidante del Aluminio. Pero no es una tarea fácil, y hay que combinar varias técnicas teóricas, y para ello hay que tocar la puerta de  expertos en diferentes campos. Aprovechando que me habían invitado a una tesis en la IGBMC de Estrasburgo, decidimos concretar una visita al grupo de Dominique con la que hemos empezado a colaborar a partir de la conferencia  Tenth Keele Meeting on Aluminum. 

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Heisenberg o la vía física a la Indeterminación

ironhorse

Del “sólo sé que no sé nada” Socrático, pasamos en 2500 años y de la mano de la ciencia, a la seguridad de que podíamos saberlo todo. La revolución Newtoniana del pensamiento parecía establecer que todo, hasta el último detalle del Universo y su evolución, estaba determinado, y esta filosofía de la Realidad ha impregnado la mentalidad occidental desde el siglo XVII. Sin embargo, de la mano de esa misma ciencia, hace casi 100 años, se descubrió un espacio irreductible de ignorancia al que estamos abocados, y sin la cual, nuestro Universo sería completamente diferente. La Ciencia descubría que el conocimiento tenía un límite, y en el camino, ha habido que repensar las bases sobre las que asentamos nuestro concepto de Realidad. ¿El culpable? Heisenberg y su principio de incertidumbre.

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Filosofadas Blogeras

triangelua_EHU

¿Qué hace un teórico con unos cuantos datos experimentales? Pues generar una teoría sobre ellos. ¿Qué hace un blogero teórico después de publicar unas cuanta entradas en un blog? Pues eso, ponerse a analizar y a teorizar. Me apetece compartir algunas reflexiones sobre la ciencia y los blogs, a partir de mi reducida experiencia. Aquí os expongo una lista de los problemas/dudas que me surgen cuando escribo entradas, cualquier consejo es bien recibido!

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Mikel Laboa, un pájaro y las ondas de materia

mikel laboa udalbide

Hegoak ebaki banizkio,
nerea izango zen,
ez zuen alde egingo
bainan honela
ez zen gehiago txoria izango
eta nik txoria nuen maite

Dice la canción de Mikel Laboa, que .. “si le cortara las alas, el pajaro sería mio, no escaparía, pero así, ya no sería más  un pájaro, y yo lo que amaba era el pájaro” . A menudo en la vida ocurren estas parádojas, cuando poseemos algo, el encanto que tenía, lo que lo definía…desaparece. Lo que probablemente no sepas es que algo así tambien ocurre con la realidad más esencial de la materia: su dualidad onda-corpúsculo.  Sí has leído bien, igual que la luz, la materia también tiene un carácter dual, sólo detectable en cuerpos de masa muy pequeña, pero ahí está, el carácter ondulatorio inherente a toda materia, incluido tú. Y como  ocurre con el pájaro de la canción, cuando intentamos observar las partículas, localizándolas en un punto del espacio, colapsamos  su ondulatoriedad, cortamos sus alas y nos quedamos con algo que ya no es lo que era. Podemos detectar las partículas, a costa de cambiar su carácter. Extraño ¿Verdad? Pues entonces merece la pena seguir leyendo.

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Newton: La Visión Mecánica de la Realidad

Sistema Solar01

En anteriores posts, hemos hablado de las diferentes teorías sobre la esencia de la realidad y de cómo conocerla. En este post, hablaremos de la influencia de la revolución Newtoniana  en la visión de la realidad. Hoy en día, quizás nos parezca evidente la filosofía inherente a la física newtoniana. Hemos perdido la capacidad de asombro de que con unas pocas leyes sencillas y universales, se puedan explicar una gran cantidad de fenómenos aparentemente inconexos entre sí. Pero ésto no era tan evidente hace cuatro siglos.

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Realidad…¿Cómo conocerte?

zollner

Bueno… pues supongamos que sí, que hay una realidad externa, que hay algo ahí fuera, y supongamos que es comprensible para nuestra mente. Como veíamos en la anterior entrada, esto ya es mucho suponer, pero partamos de ello. ¿Qué método seguirías para conocer la realidad, para comprenderla, para extraer información? Pues nada, tampoco es evidente, por lo menos para mí. Uno lee y lee a filósofos y pensadores a lo largo de la historia, y no hay unanimidad, ni mucho menos.

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Realidad… ¿Dónde estás?

mente_percepciones

Ante todo, digamos que el problema no es sencillo. A alguno os parecerá que la realidad es una “cosa” que está ahí fuera de nuestro cerebro, con una existencia objetiva e independiente del observador, generadora de los datos sensoriales. Si creéis eso, me parece genial y estáis a la altura de grandes pensadores en Física como Newton, Maxwell, Einstein, Schrödinger etc. (No digo que yo no lo crea, ya os he dicho que sólo sé que no sé nada). A esta corriente de pensamiento se le denomina en filosofía Realismo.

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